RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GNB5O14775 395 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 RFPL1O75677 317 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ACRP10323 421 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GPLD1P80108 840 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SREBF2Q12772 1141 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PICALMQ13492 652 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR1Q13613 665 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX11Q8IYF3 940 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 STK35Q8TDR2 534 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GCC1Q96CN9 775 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 WNK4Q96J92 1243 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLIM4O00461 696 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR39O43194 453 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PPATQ06203 517 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 AP3B2Q13367 1082 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 BBS9Q3SYG4 887 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PDZD3Q86UT5 571 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ERO1BQ86YB8 467 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 OPTNQ96CV9 577 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM11Q96F44 468 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 HAUS7Q99871 368 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PQU0 124 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB7P26010 798 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ADH6P28332 368 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2A2P52657 109 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 SPEM2Q0P670 501 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM209AQ5JX71 171 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 WRNIP1Q96S55 665 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 MARK1Q9P0L2 795 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-216ENST00000590105 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 CXCL11O14625 94 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 ERC2O15083 957 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D8O95759 1140 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 SDSP20132 328 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 ITKQ08881 620 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 VGLL4Q14135 290 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE3CQ15386 1083 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC9A7Q96T83 725 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 CHST12Q9NRB3 414 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms