RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.29□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.29□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 TTC3P53804 2025 aa9.29□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.29□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 KAT6AQ92794 2004 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 DCXO43602 365 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 KPNA6O60684 536 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 TBX10O75333 385 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 F11P03951 625 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 HOXC8P31273 242 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 PTK7Q13308 1070 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 CLUL1Q15846 466 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 PNMA1Q8ND90 353 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 GPATCH3Q96I76 525 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.27□□□□□ -0.92
RD3L-201ENST00000557640 LINC01565O15544 149 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 CSPG5O95196 566 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 FGAP02671 866 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 CTSHP09668 335 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 SP2Q02086 613 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RPAINQ86UA6 219 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 SERINC5Q86VE9 423 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 SNX27Q96L92 541 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 TOMM22Q9NS69 142 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 ZMYM6O95789 1325 aa9.27□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 H3BNC9 293 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 MX1P20591 662 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 HYAL1Q12794 435 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 IKBKEQ14164 716 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 ALX1Q15699 326 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 FBXO11Q86XK2 927 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 TRIM50Q86XT4 487 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 C7orf31Q8N865 590 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 BANK1Q8NDB2 785 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 PPTC7Q8NI37 304 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 PXMP2Q9NR77 195 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.26□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 PIK3R2O00459 728 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 GRM6O15303 877 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 TREHO43280 583 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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RD3L-201ENST00000557640 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 GPM6BQ13491 265 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 CAMK1Q14012 370 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 DGKDQ16760 1214 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 CD163Q86VB7 1156 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 TMEM192Q8IY95 271 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RGS22Q8NE09 1264 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 CRBNQ96SW2 442 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RMDN3Q96TC7 470 aa9.25□□□□□ -0.93
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RD3L-201ENST00000557640 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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RD3L-201ENST00000557640 INSL6Q9Y581 213 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 ABCB11O95342 1321 aa9.25□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.24□□□□□ -0.93
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RD3L-201ENST00000557640 EFCAB14O75071 495 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 GGPS1O95749 300 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 AMHP03971 560 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 RSPH10BP0C881 870 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 ALADP13716 330 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 HSD17B4P51659 736 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 GHRHRQ02643 423 aa9.24□□□□□ -0.93
RD3L-201ENST00000557640 SEMA3FQ13275 785 aa9.24□□□□□ -0.93
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