RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	STX6	O43752	255 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	MGAT3	Q09327	533 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	REST	Q13127	1097 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	RASIP1	Q5U651	963 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	C4orf19	Q8IY42	314 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	HERVK_113	Q902F9	699 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22	1e-9	■■■■□ 20.7
TTC3-223	ENST00000492275	IL17A	Q16552	155 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	RSPH3	Q86UC2	560 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	TPH2	Q8IWU9	490 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	LAD1	O00515	517 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	MAGEB2	O15479	319 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	TCTN1	Q2MV58	587 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	MTERF2	Q49AM1	385 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB39	O15060	712 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	PRPH	P41219	470 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	NME8	Q8N427	588 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	NEK9	Q8TD19	979 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	ARID2	Q68CP9	1835 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	LYPLA2	O95372	231 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	NPEPPS	P55786	919 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	METTL13	Q8N6R0	699 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	PDIA5	Q14554	519 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	IER5	Q5VY09	327 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	MED24	O75448	989 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	CLCN3	P51790	818 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275		A0A087WWV3	80 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ACTN1	P12814	892 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	CEP170P1	Q96L14	293 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	RPA1	P27694	616 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	LPIN1	Q14693	890 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ERMN	Q8TAM6	284 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRS	Q13332	1948 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	VTN	P04004	478 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	GHR	P10912	638 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	DRP2	Q13474	957 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	CLIC4	Q9Y696	253 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275		M0QZ92	97 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	TMOD1	P28289	359 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ECM1	Q16610	540 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	XKR9	Q5GH70	373 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	LRCH3	Q96II8	777 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21

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