RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PF4V1P10720 104 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2C19P33261 490 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 MOGSQ13724 837 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ACAP2Q15057 778 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 FERMT2Q96AC1 680 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 RAX2Q96IS3 184 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 FOXB1Q99853 325 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ANO3Q9BYT9 981 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD7Q9P203 1132 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 HRKO00198 91 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 MAFGO15525 162 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA12O60330 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM23O75077 832 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 LRG1P02750 347 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PTGS1P23219 599 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 NKX3-2P78367 333 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 CD276Q5ZPR3 534 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 TEPPQ6URK8 271 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 POFUT1Q9H488 388 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 GNALP38405 381 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2H3Q13889 308 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 CT83Q5H943 113 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 FYB2Q5VWT5 728 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ABI1Q8IZP0 508 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 MYL10Q9BUA6 226 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 BIN1O00499 593 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 APOL3O95236 402 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 IL33O95760 270 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PRLP01236 227 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A3Q01959 620 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY2Q08462 1091 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ODF1Q14990 250 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1841Q6NSI8 718 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 TEKT5Q96M29 485 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 NUMBLQ9Y6R0 609 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 GLI1P08151 1106 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 AGXTP21549 392 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A3P53794 718 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 TCIRG1Q13488 830 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 TOR2AQ5JU69 321 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 VASNQ6EMK4 673 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 TPH2Q8IWU9 490 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 AIFM3Q96NN9 605 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 INCENPQ9NQS7 918 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS38A1L453 326 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC2LP0C7M8 214 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MTNR1BP49286 362 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 JADE3Q92613 823 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 CSRNP2Q9H175 543 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT8Q9NY28 637 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF839A8K0R7 811 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP5P24588 427 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 STAT5AP42229 794 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 BCAR1P56945 870 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 MYBPC3Q14896 1274 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-212ENST00000491302 KCNMB1Q16558 191 aa9.99□□□□□ -0.81
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