RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SEMA3FQ13275 785 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 LAMC2Q13753 1193 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 STK38Q15208 465 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TCTN1Q2MV58 587 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 C7orf31Q8N865 590 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RDH13Q8NBN7 331 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RETREG2Q8NC44 543 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 WNT8BQ93098 351 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PGBD1Q96JS3 809 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 USP28Q96RU2 1077 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CERS4Q9HA82 394 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.06□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RFXAPO00287 272 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MEIS2O14770 477 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SPTLC2O15270 562 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PPFIA3O75145 1194 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PPP6R2O75170 966 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 IQCF3P0C7M6 154 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 XBP1P17861 261 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ME1P48163 572 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 STX1AQ16623 288 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RTN1Q16799 776 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 USP38Q8NB14 1042 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FANCBQ8NB91 859 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PPTC7Q8NI37 304 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CUL5Q93034 780 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 UIMC1Q96RL1 719 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ANO10Q9NW15 660 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MSRAQ9UJ68 235 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NR1I2O75469 434 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DEXIO95424 95 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ADCY5O95622 1261 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 IGFBP4P22692 258 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GNAQP50148 359 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TERF1P54274 439 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TRAF1Q13077 416 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 BFSP2Q13515 415 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SPRED2Q7Z698 418 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TRIM50Q86XT4 487 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FSIP1Q8NA03 581 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MAP3K14Q99558 947 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MAF1Q9H063 256 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.05□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 HAS3O00219 553 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ADAMTS3O15072 1205 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ATP9AO75110 1047 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF15O94989 841 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 F2P00734 622 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 LGALS2P05162 132 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CKBP12277 381 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SELPP16109 830 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CMA1P23946 247 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CDC27P30260 824 aa7.04□□□□□ -1.28
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