RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 RFC5P40937 340 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PSEN2P49810 448 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A3P55017 1021 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD10Q14728 455 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL17Q6UXB2 119 aa10.46□□□□□ -0.73
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SH3BP4-208ENST00000462602 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KAT2BQ92831 832 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PAGE5Q96GU1 130 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 TIPINQ9BVW5 301 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.46□□□□□ -0.73
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SH3BP4-208ENST00000462602 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CLSTN2Q9H4D0 955 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-208ENST00000462602 COL1A2P08123 1366 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 NRCAMQ92823 1304 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WWV3 80 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 HAS3O00219 553 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 DNM1LO00429 736 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB39O15060 712 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEB2O15479 319 aa10.45□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 DGAT1O75907 488 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SGPL1O95470 568 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 POSTNQ15063 836 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 MTERF2Q49AM1 385 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G4FQ68DD2 849 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 PADI6Q6TGC4 694 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 GPBP1Q86WP2 473 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC15Q8TF66 581 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 PHF24Q9UPV7 400 aa10.45□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SMC2O95347 1197 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 INSRRP14616 1297 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP11B2P19099 503 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 GUCY2CP25092 1073 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 GJA8P48165 433 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP4BP1P59074 171 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa10.44□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 CAMK4Q16566 473 aa10.44□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf31Q8N865 590 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 RETREG2Q8NC44 543 aa10.44□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 DDX12PQ92771 950 aa10.44□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.44□□□□□ -0.74
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SH3BP4-208ENST00000462602 C17orf102A2RUQ5 167 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM150BA6NC51 233 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 TBCAO75347 108 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 DNM2P50570 870 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 ASIC1P78348 528 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIK4Q16099 956 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 NBPF20Q3BBV1 942 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 ARSHQ5FYA8 562 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 SESTD1Q86VW0 696 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC65Q8IXS2 484 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-208ENST00000462602 TCP11Q8WWU5 503 aa10.43□□□□□ -0.74
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