RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 CUL4BQ13620 913 aa6.77□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 KCNB1Q14721 858 aa6.77□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 CALCRLQ16602 461 aa6.77□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.77□□□□□ -1.33
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF18P17022 549 aa6.76□□□□□ -1.33
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM86B1E9PN63 330 aa6.75□□□□□ -1.33
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C6orf48-208ENST00000395788 ATP2A1O14983 1001 aa6.75□□□□□ -1.33
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C6orf48-208ENST00000395788 USH1GQ495M9 461 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C6orf48-208ENST00000395788 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.75□□□□□ -1.33
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