RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	MED11	Q99278	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GAL80	P04387	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PDX1	P16451	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GEX1	P25596	615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TRM2	P33753	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	APT2	P36973	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ICS2	P38284	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	OPT1	P40897	799 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HXT10	P43581	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	IRC8	P47046	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SOL1	P50278	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	POP6	P53218	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRPL22	P53881	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	DIA1	P54005	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ARG7	Q04728	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TVP18	Q04767	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FMP25	Q08023	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	OXR1	Q08952	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PSF1	Q12488	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FSH3	Q99369	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	VMR1	P38735	1592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	UNG1	P12887	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PER1	P25625	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NGG1	P32494	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ALY1	P36117	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RRN10	P38204	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YBR013C	P38215	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AME1	P38313	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	KHA1	P40309	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	LAS21	P40367	830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	KTR7	P40504	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GLC8	P41818	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PHO86	P46956	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YET2	Q04210	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SEN15	Q04675	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GTO3	Q04806	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PSR2	Q07949	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRX4	Q12467	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TPK3	P05986	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SEC59	P20048	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AFT1	P22149	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RHB1	P25378	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ERG9	P29704	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PDC2	P32896	925 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YKL162C	P36052	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GPX2	P38143	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BIT2	P38346	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	UBP5	P39944	805 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ICP55	P40051	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AGP3	P43548	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GND2	P53319	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BUD17	P53727	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	INN1	P53901	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRP51	Q02950	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HOF1	Q05080	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PEX30	Q06169	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ENV9	Q08651	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FUN14	P18411	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ERD2	P18414	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	DBF4	P32325	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YOX1	P34161	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SKT5	P34226	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CSG2	P35206	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	IKI1	P38874	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AIM46	P38885	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	VAC8	P39968	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YEL020C	P39994	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YGR201C	P42936	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SAD1	P43589	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AZR1	P50080	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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