RNA–Protein interactions for RNA: YGR104C

SRB5, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB5, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB5	YGR104C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	TCA17	P32613	152 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SEC66	P33754	206 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	MRPL17	P36528	281 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	RIB1	P38066	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	DUG2	P38149	878 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	MAL33	P38157	468 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	LDB7	P38210	180 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	IML3	P38265	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CYC2	P38909	366 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YER186C	P40101	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	POG1	P40473	351 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	HXT14	P42833	540 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YAR1	P46683	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	IDS2	P46958	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	NPA3	P47122	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	COS5	P47187	383 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CCC1	P47818	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YNL260C	P53846	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SKO1	Q02100	647 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	TAF12	Q03761	539 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	BAG7	Q12128	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	HMS1	Q12398	434 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	ARP6	Q12509	438 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	VCX1	Q99385	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SNT2	P53127	1403 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	GAL80	P04387	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SPO7	P18410	259 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YSR3	P23501	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YCR101C	P25607	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	ECT1	P33412	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	ERG7	P38604	731 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	PFS1	P38872	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
SRB5	YGR104C	FAD1	P38913	306 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	VRG4	P40107	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	HXT9	P40885	567 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YJR149W	P47177	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YGR149W	P48236	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	BUD17	P53727	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	MTQ1	P53944	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	HXT11	P54862	567 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	ATG21	Q02887	496 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YML037C	Q03703	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	BCH1	Q05029	724 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	RFU1	Q08003	200 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	AKR2	Q12013	749 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	PET20	Q99373	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	QCR7	P00128	127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	COX2	P00410	251 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	URA3	P03962	267 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CKI1	P20485	582 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	HSP30	P25619	332 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	RPC25	P35718	212 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	STP2	P38704	541 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	ALP1	P38971	573 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SRP14	P38985	146 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	IME4	P41833	600 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	COS4	P43542	379 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	FMP33	P46998	180 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	AIM22	P47051	409 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YIP5	P53108	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	GET1	P53192	235 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	ORM1	P53224	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YMD8	Q03697	442 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	DXO1	Q06349	442 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	NSE1	Q07913	336 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	CRT10	Q08226	957 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	TMA16	Q08687	178 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	FRE3	Q08905	711 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SRB5	YGR104C	SUL2	Q12325	893 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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