RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W TPK3P05986 398 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W NUP2P32499 720 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MDL1P33310 695 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W KAP104P38217 918 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W EFM4P40516 257 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W GAB1P41733 394 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W STE24P47154 453 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MST27P53176 234 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W AHC1Q12433 566 aa2.72□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.71□□□□□ -1.98not detected
NSE4YDL105W AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YSC83P32792 385 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RTC2P38279 296 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MIG3P39943 394 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W DFG10P40526 253 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W CLD1P53264 445 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W HAL1Q01766 294 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W ECM7Q06200 448 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RNH203Q12338 110 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YOP1Q12402 180 aa2.71□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W OPI3P05375 206 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RPL12BP0CX54 165 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MCR1P36060 302 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W PFF1P38244 976 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YHK8P38776 514 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MNL1P38888 796 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W JEM1P40358 645 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RTT102P53330 157 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W TDA1Q03533 586 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W URC2Q04411 772 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W LIP2Q06005 328 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W AAD15Q08361 143 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.7□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W PCL1P24867 279 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W SPT10P35208 640 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W OXA1P39952 402 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W SEC28P40509 296 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W CRH1P53301 507 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MEH1Q02205 184 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YDL012CQ12489 107 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W SRN2Q99176 213 aa2.69□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W UTH1P36135 365 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W ECM8P38246 354 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W GEP4P38812 185 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MLH1P38920 769 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W EGT2P42835 1041 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W EPL1P43572 832 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W PMT5P52867 743 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W COS1P53822 381 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W ERO1Q03103 563 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W IPK1Q06667 281 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W ASA1Q06822 443 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YPR091CQ06833 770 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W LDS2Q08218 356 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W FCY22Q12119 530 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YDR061WQ12298 539 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W NAG1Q8TGN9 163 aa2.68□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W GPX2P38143 162 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W WSS1P38838 269 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W ATG18P43601 500 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W BNS1P50084 137 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YIP5P53108 310 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MLC1P53141 149 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YMR010WQ03687 405 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RCF1Q03713 159 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YET2Q04210 160 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YDL114WQ07530 308 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W PCL9Q12477 304 aa2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.66□□□□□ -1.98not detected
NSE4YDL105W TIR2P33890 251 aa2.66□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W YBL028CP38202 106 aa2.66□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W TOS2P50078 622 aa2.66□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RRN9P53437 365 aa2.66□□□□□ -1.98
NSE4YDL105W RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W CDC50P25656 391 aa2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W PUP2P32379 260 aa2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W IES6P32617 166 aa2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W OM14P38325 134 aa2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W YFH1Q07540 174 aa2.65□□□□□ -1.99
NSE4YDL105W HMS1Q12398 434 aa2.65□□□□□ -1.99
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