RNA–Protein interactions for RNA: YDL035C

GPR1, Transcript of Plasma membrane G protein coupled receptor (GPCR), yeast

Gene GPR1, Length 2,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPR1	YDL035C	TOD6	P34219	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MRPL4	P36517	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ATG7	P38862	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	EAF5	P39995	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SOL1	P50278	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	FLC3	P53121	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YGR035C	P53222	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	NRK1	P53915	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	TIM44	Q01852	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	GIS1	Q03833	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	HRT3	Q12347	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ADK2	P26364	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	UBP5	P39944	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	PIC2	P40035	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	DSD1	P53095	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YGL159W	P53110	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ODC1	Q03028	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	CUR1	Q06469	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	HXT4	P32467	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	BCK2	P33306	851 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SOL2	P37262	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YPK3	P38070	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	IST2	P38250	946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	AXL2	P38928	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MIT1	P40002	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ELO3	P40319	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	TOS3	P43637	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YJL163C	P46996	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YGL108C	P53139	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ARK1	P53974	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	TVP18	Q04767	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	IMA2	Q08295	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MDM32	Q12171	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	PET20	Q99373	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	TPK1	P06244	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	DAL2	P25335	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
GPR1	YDL035C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	COG3	P40094	801 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	PRK1	P40494	810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	HXT9	P40885	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YPT11	P48559	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SWC4	P53201	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YNL140C	P53910	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	RSC9	Q03124	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	CAC2	Q04199	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	DUS4	Q06063	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	CDC73	Q06697	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	FMP25	Q08023	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	BSC6	Q08280	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ECM3	Q99252	613 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	COX4	P04037	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ARG82	P07250	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	CKA1	P15790	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SNF6	P18888	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MRPL9	P31334	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SSS1	P35179	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YBR013C	P38215	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	ECM8	P38246	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YAL037W	P39728	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	VRG4	P40107	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	MGS1	P40151	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	HIS6	P40545	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SLS1	P42900	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	SER2	P42941	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPR1	YDL035C	YJL132W	P47014	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 98.7 ms