RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 LPIN2Q92539 896 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 NUP85Q9BW27 656 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FANCEQ9HB96 536 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MAPK4P31152 587 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 KLC2Q9H0B6 622 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRT-209ENST00000612229 ZBED6P86452 979 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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PTPRT-209ENST00000612229 ABCB6Q9NP58 842 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRT-209ENST00000612229 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRT-209ENST00000612229 A2MP01023 1474 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 KRT38O76015 456 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRT-209ENST00000612229 ITGA6P23229 1130 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 PMLP29590 882 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TSC22D1Q15714 1073 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 COPG2Q9UBF2 871 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ENC1O14682 589 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TOM1L1O75674 476 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CDC27P30260 824 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB1P30740 379 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 DDIT3P35638 169 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 BFSP2Q13515 415 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 IDI1Q13907 227 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 SNX19Q92543 992 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 H0YC42 278 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ARL4AP40617 200 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TECP42680 631 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 KRT33BQ14525 404 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 DEPTORQ8TB45 409 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SENP1Q9P0U3 644 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MYO1DO94832 1006 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.45□□□□□ -1.22
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