RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 KIF28PB7ZC32 967 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 TIGD1Q96MW7 591 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 PARP14Q460N5 1801 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 SFNP31947 248 aa8.23□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 WDR78Q5VTH9 848 aa8.23□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.22□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 MEN1O00255 615 aa8.22□□□□□ -1.09
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SMAD4-210ENST00000590061 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 GAS7O60861 476 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 CYP2C8P10632 490 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 RGS2P41220 211 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 ABL2P42684 1182 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 SYKP43405 635 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 JAK3P52333 1124 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.097e-8■■■□□ 16.8
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SMAD4-210ENST00000590061 PRR16Q569H4 304 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf99Q6UX52 265 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 MTMR9Q96QG7 549 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 PTPN18Q99952 460 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD4-210ENST00000590061 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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