RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 PIK3CDO00329 1044 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 NUCB1Q02818 461 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 MTMR1Q13613 665 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CDHR1Q96JP9 859 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PCYT2Q99447 389 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 HCSTQ9UBK5 93 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2SQ16763 222 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ASIC4Q96FT7 647 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TMX1Q9H3N1 280 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TLR9Q9NR96 1032 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CFAP54Q96N23 3096 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 IGHDP01880 384 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PTH1RQ03431 593 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 NCOA7Q8NI08 942 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 APOL5Q9BWW9 433 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 AZI2Q9H6S1 392 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 GINS2Q9Y248 185 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SQORQ9Y6N5 450 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 E7EWF7 191 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ANTXR2P58335 489 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PTPN21Q16825 1174 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 DUSP6Q16828 381 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SUSD6Q92537 303 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 NEK1Q96PY6 1258 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PLXNA3P51805 1871 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 MGEA5O60502 916 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 FGF18O76093 207 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 AVPR2P30518 371 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ERVFC1P60507 584 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 KRT76Q01546 638 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PLCB4Q15147 1175 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB33Q86T24 672 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 JADE2Q9NQC1 790 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 H0Y858 1186 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 KIF5BP33176 963 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 UBE3AQ05086 875 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 APOBRQ0VD83 1088 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 AAASQ9NRG9 546 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM260Q9NX78 707 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 DDAH1O94760 285 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 RXRAP19793 462 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TECP42680 631 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 LY9Q9HBG7 655 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.06■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 DENND3A2RUS2 1198 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ACTR2P61160 394 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ADAM2Q99965 735 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CDH22Q9UJ99 828 aa20.05■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 FSCN2O14926 492 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms