RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 METTL7BQ6UX53 244 aa22.71■■□□□ 1.23
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USP53-208ENST00000514305 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 SPOCK2Q92563 424 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 CFAP45Q9UL16 551 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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USP53-208ENST00000514305 C7orf31Q8N865 590 aa22.7■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 PPTC7Q8NI37 304 aa22.7■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 CAGE1Q8TC20 777 aa22.7■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.7■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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USP53-208ENST00000514305 GAS7O60861 476 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 KCNA2P16389 499 aa22.69■■□□□ 1.22
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USP53-208ENST00000514305 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 VWCEQ96DN2 955 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 RAB34Q9BZG1 259 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.69■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 EDIL3O43854 480 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SEMA3FQ13275 785 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 KAT2BQ92831 832 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SLC5A5Q92911 643 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 LENG9Q96B70 501 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SPATA33Q96N06 139 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SLC9A7Q96T83 725 aa22.68■■□□□ 1.22
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USP53-208ENST00000514305 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 STK24Q9Y6E0 443 aa22.68■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.67■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SLC37A4O43826 429 aa22.67■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 OR52Z1P0C646 297 aa22.67■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 IGFBP4P22692 258 aa22.67■■□□□ 1.22
USP53-208ENST00000514305 SFNP31947 248 aa22.67■■□□□ 1.22
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USP53-208ENST00000514305 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.66■■□□□ 1.22
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USP53-208ENST00000514305 HAS3O00219 553 aa22.63■■□□□ 1.21
USP53-208ENST00000514305 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
USP53-208ENST00000514305 PSMD10O75832 226 aa22.63■■□□□ 1.21
USP53-208ENST00000514305 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP53-208ENST00000514305 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP53-208ENST00000514305 STK38Q15208 465 aa22.63■■□□□ 1.21
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