RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 GPR3P46089 330 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SARSP49591 514 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 LSAMPQ13449 338 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PPP2R5DQ14738 602 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD42Q8N9B4 389 aa2.76□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa2.76□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CACNB3P54284 484 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 USP14P54578 494 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 GALEQ14376 348 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 NKPD1Q17RQ9 610 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 ANO4Q32M45 955 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 SCLT1Q96NL6 688 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 PTPN18Q99952 460 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 BTBD1Q9H0C5 482 aa2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 TOMM22Q9NS69 142 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 C14orf119Q9NWQ9 140 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 GFOD1Q9NXC2 390 aa2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 AGXTP21549 392 aa2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 DACT2Q5SW24 774 aa2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA8BA8MQT2 603 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 B8ZZF3 427 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-218ENST00000509368 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-218ENST00000509368 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
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