RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425868.5

BBX-208, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-208ENST00000425868 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 WNT11O96014 354 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TMEM253P0C7T8 217 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 CYP2C19P33261 490 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 KRT85P78386 507 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 EPHA7Q15375 998 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 FERMT2Q96AC1 680 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 LRGUKQ96M69 825 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TRIM75PA6NK02 468 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 VSTM5A8MXK1 200 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 FZD9O00144 591 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 SGSM2O43147 1006 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 APOL3O95236 402 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 SDHAP31040 664 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 GPR3P46089 330 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 GALK1P51570 392 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PDCD1Q15116 288 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 KSR2Q6VAB6 950 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 E2F7Q96AV8 911 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 SHISA4Q96DD7 197 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 GBP4Q96PP9 640 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ANO3Q9BYT9 981 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 F8W031 263 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CYBBP04839 570 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 MMEP08473 750 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 DBHP09172 617 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ODF1Q14990 250 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 UGT8Q16880 541 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 MAP9Q49MG5 647 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 C16orf92Q96LL3 132 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TEKT5Q96M29 485 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.26□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 SRGAP3O43295 1099 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA12O60330 932 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ADAMTS4O75173 837 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ZBTB7AO95365 584 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ENPP1P22413 925 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 HERVK_113P62684 666 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 GTF2H3Q13889 308 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CT83Q5H943 113 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TOR2AQ5JU69 321 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ABHD4Q8TB40 342 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 POFUT1Q9H488 388 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 EDARQ9UNE0 448 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.25□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 NUDT19A8MXV4 375 aa7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 MPOP05164 745 aa7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 BIRC2Q13490 618 aa7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 BRD3Q15059 726 aa7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.24□□□□□ -1.25
BBX-208ENST00000425868 TTC38Q5R3I4 469 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms