RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EBAG9O00559 213 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HAT1O14929 419 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PPM1NQ8N819 430 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PMEPA1Q969W9 287 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF653Q96CK0 615 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 COG8Q96MW5 612 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC151A5D8V7 595 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K6O95382 1288 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ATF3P18847 181 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 C21orf58P58505 322 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CETN1Q12798 172 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RASSF3Q86WH2 238 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DPF3Q92784 378 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EHD4Q9H223 541 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF10O15013 1369 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 APBB3O95704 486 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJB2P25686 324 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FUT2Q10981 343 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K11Q16584 847 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CMTM3Q96MX0 182 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP3Q96P20 1036 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ASB3Q9Y575 518 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMD14O00487 310 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TOR1BO14657 336 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NBNO60934 754 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TCIRG1Q13488 830 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ASIC2Q16515 512 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN21Q16825 1174 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP78Q5JTW2 689 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CGREF1Q99674 301 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TSKSQ9UJT2 592 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0U1RQJ8 604 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MUTP22033 750 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SCNN1AP37088 669 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TGFB2P61812 414 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT7Q86SF2 657 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 CEP112Q8N8E3 955 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PLIN2Q99541 437 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 MIS12Q9H081 205 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GVL5 298 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDH3A1P30838 453 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SOX11P35716 441 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPCQ03188 943 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 AP1B1Q10567 949 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STK3Q13188 491 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC153Q494R4 210 aa7.41□□□□□ -1.22
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