RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB42B2RXF5 422 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 KIF28PB7ZC32 967 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF862O60290 1169 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 HBP1O60381 514 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 JAK3P52333 1124 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 MIER3Q7Z3K6 550 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 IL27Q8NEV9 243 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 VAV3Q9UKW4 847 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 WDR81Q562E7 1941 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 EML1O00423 815 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 CAND2O75155 1236 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 SFNP31947 248 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 MCM2P49736 904 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 MGAT3Q09327 533 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 RPAINQ86UA6 219 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CSAG1-201ENST00000361211 CHRNA1P02708 482 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 ACTN1P12814 892 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 GJB2P29033 226 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PBX2P40425 430 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PRKCEQ02156 737 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 FAM26DQ5JW98 314 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 GPR153Q6NV75 609 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 RDM1Q8NG50 284 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 FAM20AQ96MK3 541 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PBX4Q9BYU1 374 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 COL1A2P08123 1366 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TBX3O15119 743 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 OATP04181 439 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 ATP2B1P20020 1258 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 KLRC1P26715 233 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PPP2R5CQ13362 524 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB123Q8N688 67 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 BANK1Q8NDB2 785 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRSQ13332 1948 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM150BA6NC51 233 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 C22orf31O95567 290 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJB2P25686 324 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 RABGGTBP53611 331 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 FAM167AQ96KS9 214 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 FAM161BQ96MY7 647 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 GBF1Q92538 1859 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MARCH6O60337 910 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 NEMFO60524 1076 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 BAIAP3O94812 1187 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 STBD1O95210 358 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 GHRP10912 638 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MCM7P33993 719 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB103AP81534 67 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 NBR1Q14596 966 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 CALCRLQ16602 461 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 RSPH3Q86UC2 560 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MYOGP15173 224 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 CUL4AQ13619 759 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 LPIN1Q14693 890 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 TIFAQ96CG3 184 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR9Q96QG7 549 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9A7Q96T83 725 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG1-201ENST00000361211 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms