RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 HBP1O60381 514 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 OATP04181 439 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 INSRRP14616 1297 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 IGBP1P78318 339 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A14Q15043 492 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 GRIK4Q16099 956 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 PTGISQ16647 500 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 NEK9Q8TD19 979 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 FAM167AQ96KS9 214 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP45Q9UL16 551 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 NRCAMQ92823 1304 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ARID2Q68CP9 1835 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 PP2D1A8MPX8 630 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SLITRK3O94933 977 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 HIC1Q14526 733 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ATL3Q6DD88 541 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 GNAT1P11488 350 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CDC25AP30304 524 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 FAAP100Q0VG06 881 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 MED24O75448 989 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 YEATS4O95619 227 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CLTBP09497 229 aa25.02■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 GRIN1Q05586 938 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 XKR3Q5GH77 459 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 KRT79Q5XKE5 535 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 CEP290O15078 2479 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM150BA6NC51 233 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SPTLC2O15270 562 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TREHO43280 583 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 HOXC8P31273 242 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 KRT85P78386 507 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 C4orf19Q8IY42 314 aa25.02■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2C9P11712 490 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 RPA1P27694 616 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 COL1A2P08123 1366 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 STBD1O95210 358 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 MTERF2Q49AM1 385 aa25■■□□□ 1.59
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HOXD4-201ENST00000306324 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25■■□□□ 1.59
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HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB10Q96DT7 871 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 AK8Q96MA6 479 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CLIC6Q96NY7 704 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE1Q96RT6 745 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CSRNP2Q9H175 543 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB39O15060 712 aa24.99■■□□□ 1.59
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HOXD4-201ENST00000306324 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 POTEGQ6S5H5 508 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087WWV3 80 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPP6R2O75170 966 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 SPECC1Q5M775 1068 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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