RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 NDUFA8P51970 172 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 ARPP19P56211 112 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 SEMA3FQ13275 785 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 GNASQ5JWF2 1037 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TSKSQ9UJT2 592 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 NFIAQ12857 509 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 BFSP1Q12934 665 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 BBS5Q8N3I7 341 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 LXNQ9BS40 222 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TMX1Q9H3N1 280 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TMEM260Q9NX78 707 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CIITAP33076 1130 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 AP3M2P53677 418 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 LRRC63Q05C16 580 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CALCOCO2Q13137 446 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 RRAGAQ7L523 313 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 LRP5O75197 1615 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 POTEB3A0JP26 581 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TRAPPC3O43617 180 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 ERCC3P19447 782 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 DDIT3P35638 169 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 MAGEA1P43355 309 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 BFSP2Q13515 415 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 POTEBQ6S5H4 581 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 RAD54LQ92698 747 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 USP54Q70EL1 1684 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 HBP1O60381 514 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 DGAT1O75907 488 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 SKIP12755 728 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 FERP16591 822 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 KRT81Q14533 505 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 PDIA5Q14554 519 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 UNC13DQ70J99 1090 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 HAUS1Q96CS2 278 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 RIT2Q99578 217 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CPA4Q9UI42 421 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 VCAM1P19320 739 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 RESTQ13127 1097 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CUL4BQ13620 913 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 USTQ9Y2C2 406 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 ESYT2A0FGR8 921 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 HUS1O60921 280 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 KRT10P13645 584 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CDC27P30260 824 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 INPP5BP32019 993 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TUBB2AQ13885 445 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CBX8Q9HC52 389 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 AAASQ9NRG9 546 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 BTAF1O14981 1849 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 RNF8O76064 485 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 DSG3P32926 999 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 MXI1P50539 228 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 OSTNP61366 133 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 HERVK_113P62684 666 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 EXOC4Q96A65 974 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 KAZALD1Q96I82 304 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 KCND2Q9NZV8 630 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOG-201ENST00000229307 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms