RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G ENT5Q03769 411 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR132CQ03900 495 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RKM2Q03942 479 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ERB1Q04660 807 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ADE13Q05911 482 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RXT3Q07458 294 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ADY3Q07732 790 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YEH1Q07804 573 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G AIM39Q08223 395 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G HRK1Q08732 759 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG29Q12092 213 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG9Q12142 997 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RFM1Q12192 310 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G USB1Q12208 290 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YOR012WQ12351 137 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YKL033W-AQ86ZR7 236 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G CYC1P00044 109 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ATP2P00830 511 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G MET17P06106 444 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RHO1P06780 209 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ERG20P08524 352 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YML003WP0CF16 290 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ARF1P11076 181 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G UNG1P12887 359 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ALG1P16661 449 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G PRP6P19735 899 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G CLN1P20437 546 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G TRK2P28584 889 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G CTS1P29029 562 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G DBF4P32325 704 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SPC110P32380 944 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G HSP150P32478 413 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G UTR5P32630 166 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G IMP3P32899 183 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YOX1P34161 385 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SWH1P35845 1188 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G PHD1P36093 366 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G BET3P36149 193 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G THI2P38141 450 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G AIM3P38266 947 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G OPY1P38271 328 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G TSC10P38342 320 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SSH1P38353 490 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RCK2P38623 610 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G DYS1P38791 387 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR097CP38809 366 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G PEX18P38855 283 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR177WP38867 453 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G NPT1P39683 429 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SWD1P39706 426 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ECM10P39987 644 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RGI2P40188 164 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG3P40344 310 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ALG8P40351 577 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G QDR2P40474 542 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data0.57□□□□□ -2.32not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G PAC11P40960 533 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SNZ3P43545 298 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RRT5P43607 289 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G AAD10P47182 288 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G BRO1P48582 844 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G UFD1P53044 361 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G HOS2P53096 452 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YRB30P53107 440 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ROG1P53118 685 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G KXD1P53158 218 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G PUS2P53167 370 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G CDH1P53197 566 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SNZ2P53824 298 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RTC4P53850 401 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G EFM6P53970 246 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G LSM3P57743 89 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G CTR9P89105 1077 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ARG5,6Q01217 863 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G AAT1Q01802 451 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G IRC15Q02733 499 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G TRS31Q03337 283 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G RCE1Q03530 315 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR166CQ03829 368 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR244WQ04018 355 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SPG4Q04438 115 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G SOV1Q04748 898 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G PEX10Q05568 337 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G BUR2Q05949 395 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data0.57□□□□□ -2.32not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G GAT3Q07928 141 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G YOR378WQ08902 515 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G THI21Q08975 551 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ELG1Q12050 791 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G ACF2Q12168 779 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G MED1Q12321 566 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G GPM3Q12326 303 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G WHI5Q12416 295 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G FRE6Q12473 712 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)GtF(GAA)G NBL1Q3E7Y6 73 aa0.57□□□□□ -2.32
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