RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B ENT5Q03769 411 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR132CQ03900 495 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RKM2Q03942 479 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ERB1Q04660 807 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ADE13Q05911 482 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RXT3Q07458 294 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ADY3Q07732 790 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YEH1Q07804 573 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM39Q08223 395 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HRK1Q08732 759 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG29Q12092 213 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG9Q12142 997 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RFM1Q12192 310 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B USB1Q12208 290 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR012WQ12351 137 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YKL033W-AQ86ZR7 236 aa0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CYC1P00044 109 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ATP2P00830 511 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MET17P06106 444 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RHO1P06780 209 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ERG20P08524 352 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YML003WP0CF16 290 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARF1P11076 181 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B UNG1P12887 359 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG1P16661 449 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PRP6P19735 899 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CLN1P20437 546 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TRK2P28584 889 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CTS1P29029 562 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B DBF4P32325 704 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPC110P32380 944 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HSP150P32478 413 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B UTR5P32630 166 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B IMP3P32899 183 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YOX1P34161 385 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SWH1P35845 1188 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PHD1P36093 366 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BET3P36149 193 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B THI2P38141 450 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM3P38266 947 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B OPY1P38271 328 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TSC10P38342 320 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SSH1P38353 490 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RCK2P38623 610 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B DYS1P38791 387 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR097CP38809 366 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX18P38855 283 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR177WP38867 453 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NPT1P39683 429 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SWD1P39706 426 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ECM10P39987 644 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RGI2P40188 164 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG3P40344 310 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG8P40351 577 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B QDR2P40474 542 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data0.57□□□□□ -2.32not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B PAC11P40960 533 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SNZ3P43545 298 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RRT5P43607 289 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AAD10P47182 288 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BRO1P48582 844 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B UFD1P53044 361 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HOS2P53096 452 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YRB30P53107 440 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ROG1P53118 685 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B KXD1P53158 218 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PUS2P53167 370 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CDH1P53197 566 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SNZ2P53824 298 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RTC4P53850 401 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B EFM6P53970 246 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B LSM3P57743 89 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CTR9P89105 1077 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARG5,6Q01217 863 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AAT1Q01802 451 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B IRC15Q02733 499 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TRS31Q03337 283 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RCE1Q03530 315 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR166CQ03829 368 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR244WQ04018 355 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPG4Q04438 115 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SOV1Q04748 898 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX10Q05568 337 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BUR2Q05949 395 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data0.57□□□□□ -2.32not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B GAT3Q07928 141 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR378WQ08902 515 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B THI21Q08975 551 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ELG1Q12050 791 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ACF2Q12168 779 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MED1Q12321 566 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GPM3Q12326 303 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B WHI5Q12416 295 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FRE6Q12473 712 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NBL1Q3E7Y6 73 aa0.57□□□□□ -2.32
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