RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W KAP120Q02932 1032 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RAD30Q04049 632 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W BOP2Q06150 570 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TRM8Q12009 286 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MED2Q12124 431 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBL029C-AQ3E756 94 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ATP12P22135 325 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DBF2P22204 572 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MRPS5P33759 307 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GET2P40056 285 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TAH11P47112 604 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CCC1P47818 322 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YAP6Q03935 383 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YLR407WQ06070 228 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W VPS54Q12071 889 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GPM3Q12326 303 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YOR012WQ12351 137 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TAT1P38085 619 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W UBA4P38820 440 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AGX1P43567 385 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TAF9Q05027 157 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SYT1Q06836 1226 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YOL029CQ08187 201 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ATG29Q12092 213 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MED4Q12343 284 aa2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W QCR6P00127 147 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DBP2P24783 546 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SUR1P33300 382 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GLG1P36143 616 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CDC1P40986 491 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YFR035CP43608 114 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PGA2P53903 129 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GIS1Q03833 894 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YOR387CQ08910 206 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RUP1Q12242 671 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W Q0142Q9ZZW4 58 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBR085C-AO43137 85 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CBS2P14905 389 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YCL002CP25565 263 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MEI5P32489 222 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBR220CP38318 560 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W EFM3P47163 339 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TCB2P48231 1178 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W LCL3P53153 274 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TEX1P53851 422 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W REC102Q02721 264 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ERV41Q04651 352 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MDM36Q06820 579 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SLP1Q12232 587 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AVL9Q12500 764 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W APA2P22108 325 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MXR2P25566 168 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PHO91P27514 894 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YSC84P32793 468 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SKN1P33336 771 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SIF2P38262 535 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBR138CP38277 524 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RCK1P38622 512 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MMS21P38632 267 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SPG5P42933 373 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GND2P53319 492 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W VPS36Q06696 566 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W NMD4Q12129 218 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GPM1P00950 247 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YMR085WP0CF18 432 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RAD51P25454 400 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W APL1P27351 700 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98 RIP-Chip
SIN3YOL004W URA8P38627 578 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YEL057CP39983 233 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MET18P40469 1032 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CIN1P40987 1014 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W POP1P41812 875 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YKE2P52553 114 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MMT1Q03218 510 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PFA5Q03289 374 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YDR131CQ03899 556 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RSM24Q03976 319 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms