RNA–Protein interactions for RNA: YML121W

GTR1, Transcript of Cytoplasmic GTPase, yeast

Gene GTR1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR1	YML121W	IVY1	Q04934	453 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	TPO3	Q06451	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SYO1	Q07395	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ATG34	Q12292	412 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	FSH3	Q99369	266 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RSR1	P13856	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YCR007C	P25354	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SPS22	P25380	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	BUB3	P26449	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ACH1	P32316	526 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	LEU5	P38702	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	VRG4	P40107	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	GPI15	P53961	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MMT1	Q03218	510 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	AIM33	Q04516	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	GLO2	Q05584	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	BOP2	Q06150	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	REX4	Q08237	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CRC1	Q12289	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	FMP16	Q12497	93 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CDC42	P19073	191 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	DOA4	P32571	926 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SKN1	P33336	771 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	IRC7	P43623	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	LOH1	P47055	219 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	HMS2	P47175	358 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YDL186W	P48568	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CIN8	P27895	1000 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SPR1	P32603	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MSN4	P33749	630 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPC25	P35718	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RCY1	P39531	840 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
GTR1	YML121W	YNL260C	P53846	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MRP51	Q02950	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CAC2	Q04199	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RRN11	Q04712	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	LDS2	Q08218	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MED4	Q12343	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	APC2	Q12440	853 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RRI1	Q12468	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	CKI1	P20485	582 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	HXT1	P32465	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ECT1	P33412	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	DOA1	P36037	715 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	PEX32	P38292	413 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	FET3	P38993	636 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	STE24	P47154	453 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	PHB2	P50085	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YIP1	P53039	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YNL050C	P53952	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	INP2	Q03824	705 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	BCP1	Q06338	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ASA1	Q06822	443 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	NRT1	Q08485	598 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ORT1	Q12375	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	GAL4	P04386	881 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MAS2	P11914	482 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	PHD1	P36093	366 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
GTR1	YML121W	YJL070C	P40361	888 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	PCI8	P40512	444 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YIL024C	P40543	189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	MNT4	P53745	580 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SMP3	Q04174	516 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTR1	YML121W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GTR1	YML121W	CLN3	P13365	580 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTR1	YML121W	YKL097C	P34245	136 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTR1	YML121W	YCR041W	P37265	110 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTR1	YML121W	RIM2	P38127	377 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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