RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	APN1	P22936	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PHO87	P25360	923 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	STP22	P25604	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TPO5	P36029	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	EXO84	P38261	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YBR285W	P38354	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TAT2	P38967	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SNO3	P43544	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PMT4	P46971	762 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SDH1	Q00711	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YML131W	Q03102	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GAS3	Q03655	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GRX3	Q03835	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YEH1	Q07804	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	STE7	P06784	515 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	NMT1	P14743	455 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PTP2	P29461	750 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MDJ1	P35191	511 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	FKH2	P41813	862 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MPS3	P47069	682 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GET1	P53192	235 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YGR067C	P53243	804 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ATG4	P53867	494 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	REC102	Q02721	264 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ATG21	Q02887	496 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SRL4	Q03085	281 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PSY3	Q12318	242 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RPC82	P32349	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PTC1	P35182	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	DOA1	P36037	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ARN1	P38731	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GOS1	P38736	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ECM10	P39987	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RPN14	P53196	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YSA1	Q01976	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GPB1	Q08886	897 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MLH3	Q12083	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	COX17	Q12287	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ATP6	P00854	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ITR2	P30606	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	NGG1	P32494	702 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PEX6	P33760	1030 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	TDP1	P38319	544 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	FAA2	P39518	744 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	VHR1	P40522	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SWP82	P43554	623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MDV1	P47025	714 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GTR2	P53290	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MET31	Q03081	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	TFB3	Q03290	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GPI17	Q04080	534 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SWF1	Q04629	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SLY41	P22215	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	AVT6	P40074	448 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	AGP3	P43548	558 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IRC6	P43615	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GPI1	P53306	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	HSP31	Q04432	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	LOT6	Q07923	191 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YEH2	Q07950	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ESA1	Q08649	445 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MUM3	Q08750	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MSS18	P08593	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	COS2	P0CX12	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	COS3	P0CX13	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	POL4	P25615	582 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	KRE6	P32486	720 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms