RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	HEM14	P40012	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	HOP2	P53187	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ARO80	Q04052	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	TAF9	Q05027	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	DAL2	P25335	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YCR007C	P25354	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SWH1	P35845	1188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YJR079W	P47126	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	FLC3	P53121	802 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	JJJ1	P53863	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RCN2	Q12044	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	VPS54	Q12071	889 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	IRA2	P19158	3079 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SUC2	P00724	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AAC3	P18238	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SAN1	P22470	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	PIM1	P36775	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YBP1	P38315	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	LAA1	P39526	2014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	TMA108	P40462	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YJL132W	P47014	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	PIR3	Q03180	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AIM32	Q04689	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	IVY1	Q04934	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	THP1	Q08231	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AYT1	Q12226	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	AGA1	P32323	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	MRP4	P32902	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	MSR1	P38714	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PET100	P38958	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PHO86	P46956	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	MRX6	P48564	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YGR066C	P53242	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	MRS2	Q01926	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	VPS74	Q06385	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	MSF1	P08425	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	EXO70	P19658	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	BRF1	P29056	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PUP2	P32379	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	TFB1	P32776	642 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	BNA4	P38169	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	SHO1	P40073	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	IRC15	Q02733	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	FIN1	Q03898	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	ATR1	P13090	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	CBS2	P14905	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PUT4	P15380	627 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	NIP100	P33420	868 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	RPC25	P35718	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PMU1	P36069	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	MRPL40	P36534	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YEL075C	P39972	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	VPS38	Q05919	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	PHO92	Q06390	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	SIL1	Q08199	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	AVL9	Q12500	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD4	YLR363C	ELO2	P25358	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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