RNA–Protein interactions for RNA: YHR204W

MNL1, Transcript of Alpha-1,2-specific exomannosidase of the endoplasmic reticulum, yeast

Gene MNL1, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL1	YHR204W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ECM3	Q99252	613 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SUC2	P00724	532 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	REP2	P03872	296 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	AI1	P03875	834 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ADE8	P04161	214 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YCL049C	P25577	312 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PGS1	P25578	521 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	DAL3	P32459	195 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	MMS4	P38257	691 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	FTH1	P38310	465 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PCL6	P40038	420 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	IRC24	P40580	263 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PAC10	P48363	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
MNL1	YHR204W	ECM9	Q02202	377 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	TRS130	Q03660	1102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	NTH1	P32356	751 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ECT1	P33412	323 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	GPT2	P36148	743 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YBR013C	P38215	129 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ATG12	P38316	186 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	FLC2	P39719	783 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PAN6	P40459	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
MNL1	YHR204W	BST1	P43571	1029 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ERV14	P53173	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YNL095C	P53932	642 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	CSN9	Q03981	162 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	TRM12	Q04235	462 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PEX12	Q04370	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	BCH1	Q05029	724 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PHO92	Q06390	306 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	GPI11	Q06636	219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	GRS2	Q06817	618 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	GUP2	Q08929	609 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	HFI1	Q12060	488 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	NYV1	Q12255	253 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	MED1	Q12321	566 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	COS2	P0CX12	379 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	COS3	P0CX13	379 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SIR1	P21691	654 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ADE1	P27616	306 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	AEP1	P32493	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	BCS1	P32839	456 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PMT1	P33775	817 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ASK1	P35734	292 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SOL2	P37262	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	HSL7	P38274	827 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YHR182W	P38870	785 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	COG3	P40094	801 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	KHA1	P40309	873 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	LCB2	P40970	561 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ABM1	P47146	123 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	MCM22	P47167	239 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	TOM22	P49334	152 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YNR062C	P53748	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SNO1	Q03144	224 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	PPN1	Q04119	674 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	CIA1	Q05583	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	ARO10	Q06408	635 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	YLL058W	Q12198	575 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SFM1	Q12314	213 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	RHO2	P06781	192 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.73	□□□□□ -1.81	not detected
MNL1	YHR204W	REV1	P12689	985 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	NFS1	P25374	497 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SNC1	P31109	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	MSN4	P33749	630 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MNL1	YHR204W	TUL1	P36096	758 aa		3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.3 ms