RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	EFM6	P53970	246 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YMD8	Q03697	442 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	IPK1	Q06667	281 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	VPS36	Q06696	566 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	AIM6	Q07716	390 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	QCR7	P00128	127 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	COX2	P00410	251 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PUT1	P09368	476 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CBS2	P14905	389 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPB8	P20436	146 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	TAF2	P23255	1407 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RRT12	P25381	491 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	COS9	P36034	407 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	DUG2	P38149	878 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YGR201C	P42936	225 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YAR1	P46683	200 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	GCV1	P48015	400 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SRT1	Q03175	343 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	IZH1	Q03419	316 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	EMP46	Q12396	444 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CDC8	P00572	216 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	TMT1	P32643	299 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	TFA2	P36145	328 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	MRPL7	P36519	292 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	GIC1	P38785	314 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ALG8	P40351	577 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SNL1	P40548	159 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YGL108C	P53139	140 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SOL4	P53315	255 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	BUD17	P53727	317 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	DXO1	Q06349	442 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YET3	Q07451	203 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	AAD15	Q08361	143 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	THI21	Q08975	551 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	KIN28	P06242	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SPE1	P08432	466 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	MRP13	P12686	339 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YMR31	P19955	123 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	CNA1	P23287	553 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YIM1	P28625	365 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	DSE1	P40077	573 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BUR6	P40096	142 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RTS2	P40962	232 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	STE24	P47154	453 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YNR040W	P53736	256 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BUR2	Q05949	395 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SFM1	Q12314	213 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ARP6	Q12509	438 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PTC6	P25646	442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GSH1	P32477	678 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SRB5	P32585	307 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	MRPL17	P36528	281 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ECM1	P39715	212 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	COX15	P40086	486 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YER186C	P40101	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BRE2	P43132	505 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	TPO1	Q07824	586 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GEP3	Q08622	556 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	AIM41	Q12032	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	STH1	P32597	1359 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	PUT2	P07275	575 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	CHS2	P14180	963 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	ITR2	P30606	609 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SET1	YHR119W	YPK3	P38070	525 aa		3.14	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.2 ms