RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C OAC1P32332 324 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C ASH1P34233 588 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YPT52P36018 234 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C APE3P37302 537 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YBR056WP38081 501 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C BSD2P38356 321 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C EXO1P39875 702 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YTA6P40328 754 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C SSU1P41930 458 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YGR201CP42936 225 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C GAT1P43574 510 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C IRC7P43623 340 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YJR115WP47152 169 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C CWC25P53854 179 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C MET31Q03081 177 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C SEG1Q04279 960 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YLR283WQ05867 314 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RTT10Q08924 1013 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C SFG1Q12507 346 aa5.1□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C SST2P11972 698 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C SLM5P25345 492 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RER1P25560 188 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C ARE1P25628 610 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data5.09□□□□□ -1.59not detected
SSZ1YHR064C KAP122P32767 1081 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C MRT4P33201 236 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C TAF14P35189 244 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C JEN1P36035 616 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RSM22P36056 628 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YBR063CP38083 404 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C ATG14P38270 344 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YHR020WP38708 688 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C PLB1P39105 664 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C PHM8P40025 321 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YIL089WP40500 205 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C HAM1P47119 197 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YJR124CP47159 448 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C ECL1P48235 211 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YNL260CP53846 198 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YSA1Q01976 231 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C TDA1Q03533 586 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C YLR346CQ06139 101 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C RSC3Q06639 885 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C IRC10Q08118 586 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C DIN7Q12086 430 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C NMD4Q12129 218 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C PEX11Q12462 236 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C TOM1Q03280 3268 aa5.09□□□□□ -1.59
SSZ1YHR064C URA3P03962 267 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HIS3P06633 220 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SIR3P06701 978 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HVG1P0CE11 249 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YAR066WP0CX18 203 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YHR214WP0CX19 203 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PET54P10834 293 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PEX34P25584 144 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CPR3P25719 182 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MRPL9P31334 269 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MLF3P32047 452 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SFP1P32432 683 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HYM1P32464 399 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SEC17P32602 292 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CAT2P32796 670 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PHO11P35842 467 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ALY1P36117 915 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TAT1P38085 619 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PHO12P38693 467 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RTT105P40063 208 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C AAD14P42884 376 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YFL052WP43551 465 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LSM1P47017 172 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BFA1P47113 574 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MDM34P53083 459 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TYW3P53177 273 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RRN9P53437 365 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LSM7P53905 115 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YNL140CP53910 189 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GPN3Q06543 272 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C FEX1Q08913 375 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ICL2Q12031 575 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TGL5Q12043 749 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MDM32Q12171 622 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YPL066WQ12194 479 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MRX4Q12467 430 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YOR338WQ99326 363 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GCN4P03069 281 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CDC21P06785 304 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C KAR1P11927 433 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RED1P14291 827 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C FPS1P23900 669 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.4 ms