RNA–Protein interactions for RNA: YHR015W

MIP6, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene MIP6, Length 1,980 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIP6	YHR015W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ECM5	Q03214	1411 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RPN13	O13563	156 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SPO12	P17123	173 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	CKI1	P20485	582 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RTC2	P38279	296 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YDL186W	P48568	277 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YIP1	P53039	248 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SMP3	Q04174	516 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SEG1	Q04279	960 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	FMP16	Q12497	93 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MYO4	P32492	1471 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	CDC42	P19073	191 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SPS22	P25380	463 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	CIN8	P27895	1000 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ITR1	P30605	584 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	TOA2	P32774	122 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	OAR1	P35731	278 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YCR041W	P37265	110 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	VPS52	P39904	641 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SIM1	P40472	476 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	STE24	P47154	453 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ATP23	P53722	227 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MSS11	Q03825	758 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	GLO2	Q05584	274 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SYO1	Q07395	620 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	THI20	Q08224	551 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YOL107W	Q12239	342 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	GLE1	Q12315	538 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ADY2	P25613	283 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	HXT1	P32465	570 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MRP4	P32902	394 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	PDR3	P33200	976 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	FRE2	P36033	711 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SPC34	P36131	295 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	FET3	P38993	636 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	FRE4	P53746	719 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ARK1	P53974	638 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	LDS2	Q08218	356 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YOR1	P53049	1477 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MDS3	P53094	1487 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SPO11	P23179	398 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MXR2	P25566	168 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SPR1	P32603	445 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
MIP6	YHR015W	RTS2	P40962	232 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RRN9	P53437	365 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YNL234W	P53857	426 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SAM50	P53969	484 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RSC9	Q03124	581 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	IRC10	Q08118	586 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SRL2	Q12020	392 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SCC2	Q04002	1493 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	PEP1	P32319	1579 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	HEM2	P05373	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ARG80	P07249	177 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	PRB1	P09232	635 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ECT1	P33412	323 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MSN4	P33749	630 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SPT10	P35208	640 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YKL162C	P36052	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	IML3	P38265	245 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SBE22	P38814	852 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	FMP33	P46998	180 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	VPS25	P47142	202 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YPT11	P48559	417 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	TIM21	P53220	239 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	YNL050C	P53952	270 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	IZH1	Q03419	316 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	ATC1	Q04005	294 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	APC4	Q04601	652 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RBD2	Q12270	262 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RPO31	P04051	1460 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	RKR1	Q04781	1562 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MIP6	YHR015W	SMC4	Q12267	1418 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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