RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	VPS52	P39904	641 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	SPG5	P42933	373 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	LAM5	P43560	674 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	GWT1	P47026	490 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	STD1	Q02794	444 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	BET5	Q03630	159 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	MUM3	Q08750	479 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	SRL2	Q12020	392 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	RNH203	Q12338	110 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AIM4	YBR194W	MAS1	P10507	462 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SAG1	P20840	650 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	COX13	P32799	129 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RIB7	P33312	244 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SKN1	P33336	771 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	DOA1	P36037	715 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YBR056W	P38081	501 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SDS24	P38314	527 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	STP2	P38704	541 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YHR122W	P38829	231 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	STE24	P47154	453 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RET3	P53600	189 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	FRE4	P53746	719 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
AIM4	YBR194W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TIM18	Q08749	192 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MAS2	P11914	482 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PUT4	P15380	627 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	OM45	P16547	393 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SPO12	P17123	173 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	CPR3	P25719	182 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MSK1	P32048	576 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SKT5	P34226	696 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YHR218W	P38899	603 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ALG8	P40351	577 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SNL1	P40548	159 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YFR018C	P43599	363 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	COS10	P52924	374 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YNL146W	P53906	100 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YLR297W	Q05899	129 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ECM7	Q06200	448 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PPT2	Q12036	173 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
AIM4	YBR194W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	GAL3	P13045	520 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ATR1	P13090	542 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MRPL8	P22353	238 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PTR2	P32901	601 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YBR139W	P38109	508 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YHR131C	P38835	850 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YHR177W	P38867	453 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MDM31	P38880	579 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MST28	P39552	234 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	HAT2	P39984	401 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SHO1	P40073	367 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ATM1	P40416	690 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	GCD10	P41814	478 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	IKS1	P47042	667 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YDL186W	P48568	277 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PMT5	P52867	743 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YGL114W	P53134	725 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RPN14	P53196	417 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	POP6	P53218	158 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	CAF40	P53829	373 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	BOR1	P53838	576 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ARK1	P53974	638 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	LDS2	Q08218	356 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	VPS63	O13549	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TPK3	P05986	398 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	HXT2	P23585	541 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ATS1	P31386	333 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97

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