RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 SMCO2A6NFE2 343 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 SLC37A4O43826 429 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PTK2Q05397 1052 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TSG101Q99816 390 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 GANQ9H2C0 597 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 DPH5Q9H2P9 285 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CES2O00748 559 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V1G2O95670 118 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ASIC2Q16515 512 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ECM1Q16610 540 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 SBK1Q52WX2 424 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 RAD54LQ92698 747 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PNMA2Q9UL42 364 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 KCNQ2O43526 872 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ACTN1P12814 892 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 MTMR9Q96QG7 549 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PSMD1Q99460 953 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 STK17AQ9UEE5 414 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 KRIT1O00522 736 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PPIP5K2O43314 1243 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NOD2Q9HC29 1040 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 GNAQP50148 359 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 COASYQ13057 564 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PBKQ96KB5 322 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.181e-19■□□□□ 9.5
PMS1-222ENST00000639501 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 STX8Q9UNK0 236 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 KLRF2D3W0D1 207 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 EDIL3O43854 480 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CAND2O75155 1236 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TDP2O95551 362 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MTMR3Q13615 1198 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TEX11Q8IYF3 940 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TLCD1Q96CP7 247 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TRIM37O94972 964 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SHBGP04278 402 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MSL1Q68DK7 614 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PROM2Q8N271 834 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MTFR1LQ9H019 292 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CLGNO14967 610 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 GHRP10912 638 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 UBE4AQ14139 1066 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R7Q15435 360 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CALCRLQ16602 461 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 GJA10Q969M2 543 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 NR2E1Q9Y466 385 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SLC8A1P32418 973 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CRYMQ14894 314 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 C12orf60Q5U649 245 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 LAMB2P55268 1798 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms