RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC41Q15345 812 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYH10P35580 1976 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 LCA5LO95447 670 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 HTRA3P83110 453 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 COASYQ13057 564 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 HYIQ5T013 277 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCTD1Q719H9 257 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 HLA-DOAP06340 250 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GGCXP38435 758 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF11P52732 1056 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GJA10Q969M2 543 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MARCH6O60337 910 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP2B2Q01814 1243 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM58Q8NG06 486 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDCA5Q96FF9 252 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH2D4AQ9H788 454 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIPA1L1O43166 1804 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC53A6NM62 1247 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 BAP1Q92560 729 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PANK4Q9NVE7 773 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNFRSF8P28908 595 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRAK1P51617 712 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFIAQ12857 509 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRAGAQ7L523 313 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAGE1Q8TC20 777 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEF6Q9H4E7 631 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 JADE2Q9NQC1 790 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF185O15231 689 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TACC1O75410 805 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASA3Q14644 834 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 EHD4Q9H223 541 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA6P17066 643 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 APLP1P51693 650 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SKOR1P84550 965 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCP10Q12799 353 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CST9Q5W186 159 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDXDC1Q6P996 788 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC17Q96LX7 622 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP89Q96ST8 783 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNTNAP1P78357 1384 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 AKR1B10O60218 316 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNMA1Q12791 1236 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNX12Q9UMY4 172 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYBL2P10244 700 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERCC3P19447 782 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 E9PMD0 336 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC26A4O43511 780 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.31■■□□□ 1.16
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