RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	SFN	P31947	248 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	JAK3	P52333	1124 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	PTK7	Q13308	1070 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	PCYT2	Q99447	389 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF302	Q9NR11	478 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP2C18	P33260	490 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	RETREG2	Q8NC44	543 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	RDM1	Q8NG50	284 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292		H3BQV1	296 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	PPFIA1	Q13136	1202 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	SNX21	Q969T3	373 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	DISC1	Q9NRI5	854 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCNX1-206	ENST00000554292	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	SETD4	Q9NVD3	440 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	TRPC6	Q9Y210	931 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CHMP2A	O43633	222 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	RBL2	Q08999	1139 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	SERINC5	Q86VE9	423 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	POTED	Q86YR6	584 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	NEMF	O60524	1076 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	TRAPPC10	P48553	1259 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	HSCB	Q8IWL3	235 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	GJA10	Q969M2	543 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	POTEB3	A0JP26	581 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CCL23	P55773	120 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	PLCB4	Q15147	1175 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	GRIK4	Q16099	956 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CALCRL	Q16602	461 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	POTEB	Q6S5H4	581 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	TDH	Q8IZJ6	230 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	HBP1	O60381	514 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CSF2RA	P15509	400 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	PDC	P20941	246 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	HIC1	Q14526	733 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	MCTP1	Q6DN14	999 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM167A	Q96KS9	214 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	TREH	O43280	583 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP2B1	P20020	1258 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	RFC2	P35250	354 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	ADAM17	P78536	824 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	PPP2R5C	Q13362	524 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PCNX1-206	ENST00000554292	SCN5A	Q14524	2016 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF28P	B7ZC32	967 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	CAND2	O75155	1236 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	INSRR	P14616	1297 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	SELP	P16109	830 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	HAS1	Q92839	578 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	IL23A	Q9NPF7	189 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	COL1A2	P08123	1366 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	PFKM	P08237	780 aa		32	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	TTC38	Q5R3I4	469 aa		32	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	VAV3	Q9UKW4	847 aa		32	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	IQCF3	P0C7M6	154 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	CKB	P12277	381 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	MCM7	P33993	719 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	SCLY	Q96I15	445 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	IGBP1	P78318	339 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		31.98	■■■□□ 2.71

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