RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAGE1Q8TC20 777 aa18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOD1Q9Y239 953 aa18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TIMP1P01033 207 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAG1P15918 1043 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYN1P17600 705 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BMP8BP34820 402 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STAT5BP51692 787 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBL2Q08999 1139 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPP2R5CQ13362 524 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTGISQ16647 500 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCYT2Q99447 389 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GDF15Q99988 308 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIPK3Q9H422 1215 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1W2PPC1 479 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BACH1O14867 736 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BFSP2Q13515 415 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM167AQ96KS9 214 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF302Q9NR11 478 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DISC1Q9NRI5 854 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VAV3Q9UKW4 847 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL1A2P08123 1366 aa18.52■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF28PB7ZC32 967 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAND2O75155 1236 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHMP4BP1P59074 171 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPFIA1Q13136 1202 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTK7Q13308 1070 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CALCRLQ16602 461 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MFSD5Q6N075 450 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SERINC5Q86VE9 423 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HAS1Q92839 578 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRO3102Q9H379 93 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAMM50Q9Y512 469 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MARCH6O60337 910 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PARNO95453 639 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC38Q5R3I4 469 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRAPQ7Z569 592 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM199Q8N511 208 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP6V0A1Q93050 837 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRPC6Q9Y210 931 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LAD1O00515 517 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HBP1O60381 514 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 30
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MARK3P27448 753 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RFC2P35250 354 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAM17P78536 824 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FPGSQ05932 587 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLCB4Q15147 1175 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MCTP1Q6DN14 999 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTMR9Q96QG7 549 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POTEB3A0JP26 581 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHMP2AO43633 222 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GABBR2O75899 941 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PFKMP08237 780 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CYP2C9P11712 490 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITGB8P26012 769 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MCM7P33993 719 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.554e-9■■□□□ 13.8
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRIK4Q16099 956 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POTEBQ6S5H4 581 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPAINQ86UA6 219 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NEK9Q8TD19 979 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BADQ92934 168 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UIMC1Q96RL1 719 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms