RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 JAK3P52333 1124 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SEMA3FQ13275 785 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 GRB14Q14449 540 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 MCM6Q14566 821 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ECM1Q16610 540 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 POTEBQ6S5H4 581 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DPP9Q86TI2 863 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 TPH2Q8IWU9 490 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 RDM1Q8NG50 284 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 LRRC15Q8TF66 581 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 FGD4Q96M96 766 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 MTRQ99707 1265 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 RBSNQ9H1K0 784 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DNM3Q9UQ16 869 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 COBLO75128 1261 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SLITRK3O94933 977 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 KCNA2P16389 499 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CYP4A11Q02928 519 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CRHR2Q13324 411 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CUL4BQ13620 913 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DYDC2Q96IM9 177 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 FAM117AQ9C073 453 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 RMND1Q9NWS8 449 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 RGL1Q9NZL6 768 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SAMM50Q9Y512 469 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 WDR64B1ANS9 1081 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 E9PMD0 336 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 PLA2G4BP0C869 781 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CASP1P29466 404 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF165P49910 485 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 MORC3Q14149 939 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 NEDD9Q14511 834 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 MORN1Q5T089 497 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ISM2Q6H9L7 571 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 KCNK18Q7Z418 384 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 HOMEZQ8IX15 550 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 NACC1Q96RE7 527 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM9Q9C026 710 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MYMKA6NI61 221 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 AOC2O75106 756 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 EYA4O95677 639 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CCNE2O96020 404 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 FECHP22830 423 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SP2Q02086 613 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MAP2K5Q13163 448 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 KCNB1Q14721 858 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 UVSSAQ2YD98 709 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ARMCX2Q7L311 632 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MLKLQ8NB16 471 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 RNF214Q8ND24 703 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DDX12PQ92771 950 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 LXNQ9BS40 222 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DACH1Q9UI36 760 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 A0A087WWV3 80 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 LYPLA2O95372 231 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PSAPP07602 524 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MAP2K2P36507 400 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SLC12A3P55017 1021 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ACTR2P61160 394 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PSMC5P62195 406 aa11.63□□□□□ -0.55
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