RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANKRD35Q8N283 1001 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 D2HGDHQ8N465 521 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 CLEC4DQ8WXI8 215 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 AGAP2Q99490 1192 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 JAM3Q9BX67 310 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTGFRNQ9P2B2 879 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF839A8K0R7 811 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 CAPN14A8MX76 684 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 FOXN1O15353 648 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 HMGCRP04035 888 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTGS2P35354 604 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 FSTL1Q12841 308 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 FOXL1Q12952 345 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 NFYCQ13952 458 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 OTOP3Q7RTS5 596 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PROSER1Q86XN7 944 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMPRSS6Q8IU80 811 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 KREMEN2Q8NCW0 462 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 KCTD13Q8WZ19 329 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPRASP2Q96D09 838 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 MPHOSPH9Q99550 1183 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 BACH2Q9BYV9 841 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 RIOX1Q9H6W3 641 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPR27Q9NS67 375 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 DSEQ9UL01 958 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 STRIP2Q9ULQ0 834 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTPN22Q9Y2R2 807 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PCSK5Q92824 1860 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPFIA4O75335 1185 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 GCP02774 474 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 CDK4P11802 303 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 LCP1P13796 627 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 ETV4P43268 484 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 FANCCQ00597 558 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 DPH6Q7L8W6 267 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 OTOP2Q7RTS6 562 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 RTKN2Q8IZC4 609 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 NLGN4XQ8N0W4 816 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 SYNE4Q8N205 404 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 RASGRP4Q8TDF6 673 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 SEC16BQ96JE7 1060 aa2.72□□□□□ -1.97
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RNU6-561P-201ENST00000516222 FBXL7Q9UJT9 491 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-561P-201ENST00000516222 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.71□□□□□ -1.98
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RNU6-561P-201ENST00000516222 GFRA1P56159 465 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 RACK1P63244 317 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP2.71□□□□□ -1.98
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RNU6-561P-201ENST00000516222 KIZQ2M2Z5 673 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 KCTD1Q719H9 257 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF627Q7L945 461 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF227Q86WZ6 799 aa2.71□□□□□ -1.98
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RNU6-561P-201ENST00000516222 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa2.71□□□□□ -1.98
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RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM184BQ9ULE4 1060 aa2.71□□□□□ -1.98
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RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 MASP2O00187 686 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARNTLO00327 626 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 DDAH1O94760 285 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 COL6A2P12110 1019 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 GRK2P25098 689 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 GRK3P35626 688 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 EPHA5P54756 1037 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 CYP4F3Q08477 520 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 MAP4K2Q12851 820 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTPAQ15257 358 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 TNNI3KQ59H18 835 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-561P-201ENST00000516222 STRIP1Q5VSL9 837 aa2.7□□□□□ -1.98
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