RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CRTAM	O95727	393 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	LTF	P02788	710 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	GNAT1	P11488	350 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	GRIN1	Q05586	938 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PAK1	Q13153	545 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ARVCF	O00192	962 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	MAFK	O60675	156 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ITGA1	P56199	1179 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	GJA9	P57773	515 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	NKX3-2	P78367	333 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TUSC3	Q13454	348 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	KY	Q8NBH2	561 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	DSE	Q9UL01	958 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	RGS12	O14924	1447 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	WNT9A	O14904	365 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	RASGRP1	O95267	797 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	AMY2A	P04746	511 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PYGM	P11217	842 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	AMY2B	P19961	511 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	THBS2	P35442	1172 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ADAM17	P78536	824 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ADAM9	Q13443	819 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CARF	Q8N187	725 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SCLY	Q96I15	445 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ACOT7	O00154	380 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CKM	P06732	381 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PDE6A	P16499	860 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CNR2	P34972	360 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	DNM2	P50570	870 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	EPHA5	P54756	1037 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	JAM2	P57087	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CPZ	Q66K79	652 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ETV1-222	ENST00000493831	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms