RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424585.1

NEB-208, Transcript of nebulin, human

TSL 3

Gene NEB, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEB-208	ENST00000424585	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585		H0Y858	1186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	MSC	O60682	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	CUTA	O60888	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	COMT	P21964	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	GRK2	P25098	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	GRK3	P35626	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	TGFB2	P61812	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEB-208	ENST00000424585	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	BLACE	A4D250	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	RAD17	O75943	681 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	IL18BP	O95998	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	GNAT1	P11488	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	POLD1	P28340	1107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	GLRB	P48167	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	RAC3	P60763	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	FHL2	Q14192	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	DSE	Q9UL01	958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	FGFR1	P11362	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	RBL2	Q08999	1139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	CDC6	Q99741	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	LTF	P02788	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	COL6A2	P12110	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	GPR85	P60893	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585		Q6ZSN1	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ACOT7	O00154	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ZNF202	O95125	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	CR2	P20023	1033 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SERINC3	Q13530	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	RASA3	Q14644	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	NTRK3	Q16288	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEB-208	ENST00000424585	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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