RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA2O43364 376 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KLRC1P26715 233 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 JAK3P52333 1124 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 STOX1Q6ZVD7 989 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM50Q86XT4 487 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 BANK1Q8NDB2 785 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D5Q92609 795 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TIFAQ96CG3 184 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM260Q9NX78 707 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NEDD4P46934 1319 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 URODP06132 367 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CD19P15391 556 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CSF2RAP15509 400 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NT5C2P49902 561 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ALX1Q15699 326 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KRT40Q6A162 431 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SV2BQ7L1I2 683 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CNNM3Q8NE01 707 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LAMB2P55268 1798 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC3O43617 180 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NPM3O75607 178 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KCNA5P22460 613 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GJA5P36382 358 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 OAZ1P54368 228 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 AP3B2Q13367 1082 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CEP135Q66GS9 1140 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF384Q8TF68 577 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DHX58Q96C10 678 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 POLD4Q9HCU8 107 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGA4P13612 1032 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 VEPH1Q14D04 833 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DNERQ8NFT8 737 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NPLOC4Q8TAT6 608 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA1Q92805 767 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GMCL1Q96IK5 515 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD18B2RXH4 712 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ARVCFO00192 962 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 INSRRP14616 1297 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CDR1P51861 262 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 ME3Q16798 604 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ADALQ6DHV7 355 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 TEPSINQ96N21 525 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 OSMRQ99650 979 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TTC28Q96AY4 2481 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KNL1Q8NG31 2342 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PASKQ96RG2 1323 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB14O75071 495 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 COBLO75128 1261 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH2P05091 517 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SELPP16109 830 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MCM4P33991 863 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GJA8P48165 433 aa4.91□□□□□ -1.62
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