RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SNED1Q8TER0 1413 aa9.31□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KLRF2D3W0D1 207 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF4AO95239 1232 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GNA11P29992 359 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TXKP42681 527 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC41Q15345 812 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FUKQ8N0W3 1084 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SEC14L1Q92503 715 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX12PQ92771 950 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC45Q96CN5 670 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TSG101Q99816 390 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GANQ9H2C0 597 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CPVLQ9H3G5 476 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 C6orf50Q9HD87 102 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DONSONQ9NYP3 566 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ESYT2A0FGR8 921 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP2R2AP63151 447 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NEDD9Q14511 834 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC125Q86Z20 511 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TATDN2Q93075 761 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP63Q96MT8 703 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.3□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 POTEMA6NI47 508 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNK3O14649 394 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC37A4O43826 429 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TMOD1P28289 359 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FLT3P36888 993 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 COASYQ13057 564 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PDIA5Q14554 519 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RPS6KA1Q15418 735 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MSL1Q68DK7 614 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RAPGEF5Q92565 580 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SGSM3Q96HU1 749 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PBKQ96KB5 322 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NENFQ9UMX5 172 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP8B3O60423 1300 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MMP10P09238 476 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TSPY3P0CV98 308 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TSPY8P0CW00 308 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RASA1P20936 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ELF1P32519 619 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 XRCC4Q13426 336 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CALCRLQ16602 461 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ECM1Q16610 540 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TAF4BQ92750 862 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC114Q96M63 670 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM260Q9NX78 707 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.29□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC188H7C350 402 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAF5O00463 557 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SMARCA1P28370 1054 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MTMR3Q13615 1198 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SEPT2Q15019 361 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SNCBQ16143 134 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ASIC2Q16515 512 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms