RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CFBP00751 764 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MNAT1P51948 309 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 AMPD2Q01433 879 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TCP10Q12799 353 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KLK7P49862 253 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DENND2CQ68D51 928 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PODNQ7Z5L7 613 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SRLQ86TD4 932 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POTEB3A0JP26 581 aa9.64□□□□□ -0.87
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HERC3-201ENST00000264345 CES2O00748 559 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SPOPO43791 374 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EYA4O95677 639 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF8P28908 595 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CRKP46108 304 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CCT5P48643 541 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R7Q15435 360 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POTEBQ6S5H4 581 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FAM160B2Q86V87 743 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SFR1Q86XK3 245 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CCDC114Q96M63 670 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MTMR9Q96QG7 549 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 E7EVH7 732 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 H3BQF6 201 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ABCD1P33897 745 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SLC7A5Q01650 507 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NPY5RQ15761 445 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DOK7Q18PE1 504 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MORC4Q8TE76 937 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BICD1Q96G01 975 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ACCSQ96QU6 501 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EHD4Q9H223 541 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KCND2Q9NZV8 630 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NFU1Q9UMS0 254 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CCDC169A6NNP5 214 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ZNF185O15231 689 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NR1D1P20393 614 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KRT71Q3SY84 523 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CAVIN3Q969G5 261 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 H0YCG3 227 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MAN1A1P33908 653 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CYP2J2P51589 502 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LIN9Q5TKA1 542 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LRP5O75197 1615 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KA5O75582 802 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DESP17661 470 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MSL1Q68DK7 614 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MASTLQ96GX5 879 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 K7ENM7 598 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NCK2O43639 380 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CYTH3O43739 400 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MUTP22033 750 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PRELPP51888 382 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 STAT2P52630 851 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 WDR44Q5JSH3 913 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ODR4Q5SWX8 454 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PNMA5Q96PV4 448 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SLC37A4O43826 429 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CNKSR1Q969H4 720 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GJA10Q969M2 543 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MFAP3P55082 362 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HPS3Q969F9 1004 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.62□□□□□ -0.87
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