RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 LAD1O00515 517 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 PRPHP41219 470 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 IQCDQ96DY2 449 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 HINFPQ9BQA5 517 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 CCDC174Q6PII3 467 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SH2D4AQ9H788 454 aa22.23■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 PRLRP16471 622 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 GNGT1P63211 74 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 DRC1Q96MC2 740 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 RUFY1Q96T51 708 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SYT17Q9BSW7 474 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 CUEDC2Q9H467 287 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 OPLAHO14841 1288 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ZNF263O14978 683 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 CALCRLQ16602 461 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 GPC2Q8N158 579 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MTMR9Q96QG7 549 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SH3GL2Q99962 352 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.22■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 PPP1R2P41236 205 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 EPHB4P54760 987 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 PDE4DQ08499 809 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MIIPQ5JXC2 388 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 CCDC181Q5TID7 509 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 LRRC15Q8TF66 581 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 EMBQ6PCB8 327 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 DLK2Q6UY11 383 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 GGA3Q9NZ52 723 aa22.21■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ERLIN2O94905 339 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MOCS3O95396 460 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 TBC1D5Q92609 795 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 DEF6Q9H4E7 631 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 HSF2BPO75031 334 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ALS2CLQ60I27 953 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ANO3Q9BYT9 981 aa22.2■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ASIC1P78348 528 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 STIM2Q9P246 746 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 GRIN2DO15399 1336 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PLCG1P19174 1290 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 KIF11P52732 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SLC7A5Q01650 507 aa22.19■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 GUCY2CP25092 1073 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PAFAH1B1P43034 410 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CABP7Q86V35 215 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 TRIM9Q9C026 710 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 POTEMA6NI47 508 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 LIG3P49916 1009 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 STK4Q13043 487 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 HAS1Q92839 578 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 YY1AP1Q9H869 796 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 RNF181Q9P0P0 153 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.18■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 A6NNZ2 444 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 AKR1B10O60218 316 aa22.17■■□□□ 1.14
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