RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	RER1	P25560	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ISF1	P32488	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ISC10	P32645	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YBR056W	P38081	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	IST2	P38250	946 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	EFM1	P38732	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	GIP4	P39732	760 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MIT1	P40002	666 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MET28	P40573	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SLS1	P42900	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PMT4	P46971	762 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	IBA57	P47158	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MRPS35	P53292	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HXT11	P54862	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SPR28	Q04921	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SPO75	Q07798	868 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ACM1	Q08981	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	INP53	Q12271	1107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SAN1	P22470	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	EMC1	P25574	760 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CDC50	P25656	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	COQ2	P32378	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	LOT5	P34234	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FMP23	P38231	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SER2	P42941	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MOG1	P47123	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SAE3	P89114	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PEX12	Q04370	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ADY4	Q05955	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	THI7	Q05998	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SPC3	Q12133	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
EXO1	YOR033C	NYV1	Q12255	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SFM1	Q12314	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AFI1	Q99222	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SPO14	P36126	1683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AI3	P03877	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PEP5	P12868	1029 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CBS2	P14905	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FRE1	P32791	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SSS1	P35179	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SPC34	P36131	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BIG1	P38813	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FET4	P40988	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AIM23	P47015	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SNN1	P48232	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HLJ1	P48353	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NBP35	P52920	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RIM8	P53179	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MSC1	Q03104	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CAC2	Q04199	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ECM18	Q04623	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SMA2	Q04658	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CSM4	Q08955	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	REP2	P03872	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SNF3	P10870	884 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GRR1	P24814	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRPL9	P31334	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
EXO1	YOR033C	LST4	P34239	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRPL4	P36517	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ECM8	P38246	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YJL206C	P39529	758 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PRK1	P40494	810 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NSE4	P43124	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NET1	P47035	1189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ECM27	P47144	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AAD10	P47182	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	JAC1	P53193	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PFA5	Q03289	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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