RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SGF29	P25554	259 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BEM1	P29366	551 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TKL2	P33315	681 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YKL100C	P34248	587 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PHO11	P35842	467 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CAF4	P36130	643 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PHO12	P38693	467 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	STB5	P38699	743 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YHR131C	P38835	850 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GIP4	P39732	760 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YJL070C	P40361	888 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MET18	P40469	1032 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SYG1	P40528	902 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CDC1	P40986	491 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SNG1	P46950	547 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IDS2	P46958	469 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BIR1	P47134	954 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YJR154W	P47181	346 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BOL2	P53082	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CLD1	P53264	445 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YAP1802	P53309	568 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YNR068C	P53754	272 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IBD2	P53892	351 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PET117	Q02771	107 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MUK1	Q02866	612 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TLG1	Q03322	224 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RAD33	Q04231	177 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TRM12	Q04235	462 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PEX12	Q04370	399 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FMP45	Q07651	309 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YOR389W	Q08912	624 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YDR056C	Q12025	205 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.46	□□□□□ -1.54	not detected
PSH1	YOL054W	UBX3	Q12229	455 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RMD5	Q12508	421 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BET2	P20133	325 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CIN8	P27895	1000 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	NUP2	P32499	720 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	DSS4	P32601	143 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COX13	P32799	129 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PTM1	P32857	523 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SKT5	P34226	696 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SPC34	P36131	295 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ECM8	P38246	354 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
PSH1	YOL054W	LRO1	P40345	661 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PET130	P47065	347 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BUL1	P48524	976 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SPR6	Q01684	191 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	URC2	Q04411	772 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	HOF1	Q05080	669 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GPI11	Q06636	219 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RCN2	Q12044	265 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	NUS1	Q12063	375 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YLR049C	Q12110	428 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	AFI1	Q99222	893 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARG3	P05150	338 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SIR3	P06701	978 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COS2	P0CX12	379 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COS3	P0CX13	379 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	HCM1	P25364	564 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MRPL17	P36528	281 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YBR139W	P38109	508 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IFA38	P38286	347 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FHL1	P39521	936 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COS4	P43542	379 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	KEL2	P50090	882 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	EFM6	P53970	246 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	NUP100	Q02629	959 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RCF1	Q03713	159 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CRN1	Q06440	651 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.44	□□□□□ -1.54	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.1 ms