RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI2	YOL007C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RAD57	P25301	460 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	HXT1	P32465	570 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	NAT2	P37293	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	YFL067W	P43537	175 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	BRO1	P48582	844 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	MDG1	P53885	366 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	PEX25	Q02969	394 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	NDL1	Q06568	189 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	HEM15	P16622	393 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SWI3	P32591	825 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	YEL045C	P32616	141 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	KKQ8	P36004	724 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	HEL1	P36113	551 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RIB5	P38145	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	FAD1	P38913	306 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	STN1	P38960	494 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	WSC2	P53832	503 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	MMT1	Q03218	510 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	NSE1	Q07913	336 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SRL2	Q12020	392 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	YLR108C	Q12259	485 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	PDE2	P06776	526 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	ALG1	P16661	449 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SDH3	P33421	198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RXT2	P38255	430 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	APE4	P38821	490 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	EFM4	P40516	257 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	MLC1	P53141	149 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	PIB2	P53191	635 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	YDR541C	Q03049	344 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	ESA1	Q08649	445 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SKS1	Q12505	502 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	CHS1	P08004	1131 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SPO12	P17123	173 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	ITR1	P30605	584 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	CEX1	Q12453	761 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSI2	YOL007C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	CDC21	P06785	304 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	DST1	P07273	309 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YBR056W	P38081	501 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	INM1	P38710	295 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PAC11	P40960	533 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SFH5	P47008	294 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	AZR1	P50080	613 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	GOR1	P53839	350 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	EOS1	P53938	366 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	STD1	Q02794	444 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PPM1	Q04081	328 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	BCH1	Q05029	724 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	IMA3	P0CW40	589 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	IMA4	P0CW41	589 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SLY1	P22213	666 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PHO91	P27514	894 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.7	□□□□□ -1.98	not detected
CSI2	YOL007C	DAD2	P36162	133 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MLH1	P38920	769 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PHB2	P50085	310 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	HXT11	P54862	567 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	HER2	Q03557	464 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NDE2	Q07500	545 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YFH1	Q07540	174 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	IMA2	Q08295	589 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ERV2	Q12284	196 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SRN2	Q99176	213 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	CPR4	P25334	318 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
CSI2	YOL007C	YBL059W	P34224	193 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PFF1	P38244	976 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	WSS1	P38838	269 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	GPI16	P38875	610 aa		2.69	□□□□□ -1.98

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