RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	HIT1	P46973	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	AIM22	P47051	409 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	KAP114	P53067	1004 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	YDR541C	Q03049	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	YLR283W	Q05867	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	GMC2	Q06201	188 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	NDL1	Q06568	189 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	CRT10	Q08226	957 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SWM1	Q12379	170 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	PDR18	P53756	1333 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	TUS1	Q06412	1307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ZRC1	P20107	442 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
YMD8	YML038C	URK1	P27515	501 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	CWP1	P28319	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ECT1	P33412	323 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ARA1	P38115	344 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	YIL001W	P40560	513 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	STB2	P46679	850 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	DIA3	P52290	468 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ASI2	P53895	289 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	VAC7	P53950	1165 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	DIA1	P54005	336 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	REC102	Q02721	264 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	COX20	Q04935	205 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	PIG1	Q06216	648 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	MRPL35	Q06678	367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SNA4	Q07549	140 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SHS1	Q07657	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	YDL109C	Q12103	647 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	ATG31	Q12421	196 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SEY1	Q99287	776 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	YLR415C	O13578	112 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YSR3	P23501	404 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MGR1	P25573	417 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YUR1	P26725	428 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	GSY2	P27472	705 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ECM25	P32525	599 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	STE14	P32584	239 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RPC25	P35718	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YHR112C	P38716	378 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YJL206C	P39529	758 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	IBA57	P47158	497 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RNT1	Q02555	471 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PRM15	Q03262	622 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RAD3	P06839	778 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PMR1	P13586	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	KIN82	P25341	720 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CIN8	P27895	1000 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YIM1	P28625	365 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	IML3	P38265	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YBR259W	P38338	688 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	AGE2	P40529	298 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SAD1	P43589	448 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YJL118W	P47022	219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	UBX6	P47049	396 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MRPL50	P53724	139 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	TAF12	Q03761	539 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ARP10	Q04549	284 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	THI7	Q05998	598 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ARO10	Q06408	635 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YLR040C	Q07988	224 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	TIP41	Q12199	356 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RRD2	Q12461	358 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ECM3	Q99252	613 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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