RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	IGO1	P53897	168 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	DIC1	Q06143	298 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	RSA1	Q08932	381 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	VIK1	Q12045	647 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	BMT6	Q12291	365 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	MER1	P16523	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	GRR1	P24814	1151 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	YRO2	P38079	344 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	SWD1	P39706	426 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	AIM2	P39721	246 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	YJL068C	P40363	299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	MRPS18	P42847	217 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	SED5	Q01590	340 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	SPO77	Q06134	477 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	YEH1	Q07804	573 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	YLR030W	Q07967	263 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRM9	YML014W	PUT2	P07275	575 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	POL4	P25615	582 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	IBA57	P47158	497 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	RIM21	P48565	533 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	SFM1	Q12314	213 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	VPS33	P20795	691 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	SLY41	P22215	453 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	RPC82	P32349	654 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.94	□□□□□ -0.5	not detected
TRM9	YML014W	YEL020C	P39994	560 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	LAS21	P40367	830 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YGR201C	P42936	225 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YPR097W	Q06839	1073 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YMC1	P32331	307 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	FAU1	P40099	211 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	RHO4	Q00246	291 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YLR456W	Q06199	204 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	GIC2	Q06648	383 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	SKM1	Q12469	655 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	IMG1	P25626	169 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	FAR7	P43592	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	SIZ1	Q04195	904 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	ENT2	Q05785	613 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	MCA1	Q08601	432 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	FAR1	P21268	830 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	ARE1	P25628	610 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	MPM1	P40364	252 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YGR012W	P53206	393 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	ATF2	P53296	535 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	LOT6	Q07923	191 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	FDH1	Q08911	376 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	TIM9	O74700	87 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	RPB5	P20434	215 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	LOT5	P34234	306 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	MTG2	P38860	518 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	QDR2	P40474	542 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	CFD1	P40558	293 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	REC102	Q02721	264 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	YPL107W	Q02873	248 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRM9	YML014W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	CDC4	P07834	779 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	MRPL32	P25348	183 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	UBC8	P28263	218 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	MKK1	P32490	508 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	MRPL6	P32904	214 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	NUF2	P33895	451 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	RSC9	Q03124	581 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	RIM13	Q03792	727 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	KRE28	Q04431	385 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	BSC6	Q08280	497 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	TSC13	Q99190	310 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	RIB3	Q99258	208 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	RER1	P25560	188 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRM9	YML014W	PEP12	P32854	288 aa		11.88	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78 ms