RNA–Protein interactions for RNA: YGL180W

ATG1, Transcript of Protein serine/threonine kinase, yeast

Gene ATG1, Length 2,694 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG1	YGL180W	YPK3	P38070	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RRN10	P38204	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YFL015C	P43578	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YGL117W	P53133	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YGR067C	P53243	804 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YNR014W	P53719	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	TRS23	Q03784	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RXT3	Q07458	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	NRT1	Q08485	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RAX1	Q08760	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	CKA2	P19454	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	GID7	P25569	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	ICS2	P38284	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YGR117C	P53270	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	LOT6	Q07923	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	IMA2	Q08295	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	MED4	Q12343	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
ATG1	YGL180W	SHP1	P34223	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	INM1	P38710	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	PAC11	P40960	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RRN9	P53437	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RAV1	P47104	1357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	MEI5	P32489	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RAD24	P32641	659 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	RPC25	P35718	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	MMS21	P38632	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	LEU5	P38702	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	FET3	P38993	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	END3	P39013	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YMR134W	P40207	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	SDS3	P40505	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YJL118W	P47022	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YGL114W	P53134	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YNL260C	P53846	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	THP1	Q08231	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	CDC23	P16522	626 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YPK2	P18961	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	ADE1	P27616	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	CIN8	P27895	1000 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YAL037W	P39728	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	YIR016W	P40572	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	PTR3	P43606	678 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	KAP114	P53067	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	BIO4	P53630	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG1	YGL180W	AIM29	P36154	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	YMC2	P38087	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	SLX1	P38324	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	SMF2	P38778	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	SNO2	P53823	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	BET4	Q00618	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	GLE1	Q12315	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	GSY2	P27472	705 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	YKR073C	P36153	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	EXO1	P39875	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	LAS21	P40367	830 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	FMC1	P40491	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	YHC3	P47040	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	COG2	P53271	262 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	IZH1	Q03419	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	HSP31	Q04432	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	ARO10	Q06408	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	RUP1	Q12242	671 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	OPI3	P05375	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	CKI1	P20485	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	FAR1	P21268	830 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	YIL060W	P40519	144 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	BNA6	P43619	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	TRS85	P46944	698 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	ABM1	P47146	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	TAF6	P53040	516 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG1	YGL180W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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